Fluxbox wird komplett über eine Hand voll Konfigurationsdateien gesteuert welche sich unter ~/.fluxbox befinden.
Einen Überblick erhält man in den Manpages von fluxbox und fluxbox-keys.
Eine Konfiguration ist unter .fluxbox abgelegt.
Um ein Hintergundbild für Fluxbox festzulegen wird der Befehl fbsetbg verwendet. Mit der Option -f wird ihm ein Bild mitgegeben welches Fluxbox Bildschirmfüllend als Hintergrundbild darstellt.
Um schöner Fenster wechseln zu können außer Alt-Tab zu verwenden kann Fensterwechsel mit Skippy-xd verwendet werden.