Java wurde nie direkt für FreeBSD entwickelt. Daher ist hin und wieder der Betrieb von Java-Anwendungen auf FreeBSD etwas problematisch. Es gibt aus diesem Grund auch mehrere Java-Implementierungen für FreeBSD.

• jdk16 ist die Originalimplementierung von Sun und dennoch leider recht problematisch.

• diablo-jdk16 ist die Portierung des JDK von Sun und auch von Sun zertifiziert.

• openjdk6 ist die GPL-basierte Standardimplementierung von Java. (Benötigt zum kompilieren das diablo-jdk).

Um eine Software zum Laufen zu bekommen muss ein JDK gewählt werden. Eine Rangfolge als Vorschlag wäre die folgende. Bestimme Software läuft nicht mit jedem JDK. So benötigt der Minecraft-Client zum Beispiel java/linux-sun-jdk16.

1. java/openjdk6
2. java/diablo-jdk16
3. java/jdk16
4. java/linux-sun-jdk16